Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf39A2RT81 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf39A2RT81 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms