Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Samt1A2BED8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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