Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtf1A2AQ19 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtf1A2AQ19 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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