Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms