Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syndig1A2ANU3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms