Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cavin4A2AMM0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cavin4A2AMM0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms