Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd1A2AKB4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms