Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm12A2AJ77 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms