Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ambra1A2AH22 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ambra1A2AH22 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms