Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms