Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp8nlA2ABX0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms