Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A0A0U1RNP2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A0A0U1RNP2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms