Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3238W4VSP7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms