Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3550W4VSN7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms