Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Top3bQ9Z321 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms