Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac5Q9Z2V6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms