Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Knop1Q9Z2Q2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms