Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubl3Q9Z2M6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms