Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms