Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptgdr2Q9Z2J6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms