Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd1Q9Z2E2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms