Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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