Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccne2Q9Z238 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms