Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trip6Q9Z1Y4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms