Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap3b1Q9Z1T1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms