Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VarsQ9Z1Q9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms