Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nfs1Q9Z1J3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nfs1Q9Z1J3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms