Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms