Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmg20bQ9Z104 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms