Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ap4s1Q9WVL1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4s1Q9WVL1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms