Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms