Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms