Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme4Q9WV84 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme4Q9WV84 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms