Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnip1Q9WUU8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms