Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam50bQ9WTJ8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms