Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubd1Q9R1K7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms