Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfwd2Q9R1A8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfwd2Q9R1A8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfwd2Q9R1A8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfwd2Q9R1A8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfwd2Q9R1A8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfwd2Q9R1A8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfwd2Q9R1A8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfwd2Q9R1A8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfwd2Q9R1A8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfwd2Q9R1A8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfwd2Q9R1A8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfwd2Q9R1A8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfwd2Q9R1A8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms