Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed2Q9R0Q3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms