Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt71Q9R0H5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms