Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod1Q9R0E2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms