Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vav3Q9R0C8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vav3Q9R0C8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms