Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms