Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms