Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fhl3Q9R059 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fhl3Q9R059 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms