Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AmfrQ9R049 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms