Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf4Q9QZS2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf4Q9QZS2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rnf4Q9QZS2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rnf4Q9QZS2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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