Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a3Q9QZB6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms