Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn8Q9QZ49 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms