Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PnckQ9QYK9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PnckQ9QYK9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms