Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms